熒光顯微鏡技術是目前在光鏡水平對特異卵白質等生物大分子定性定位研究的非常有力工具之一。熒(ying)光顯微鏡技術主要是用于檢驗細胞上的特異熒光質料，與普通光學顯微鏡不同的是熒光顯微鏡(jing)增長了兩套濾光片。一個稱為激發光濾片，裝在光源和樣品之間，只有那些能激發熒光質料發光的特定波長的光才能通過。另外一個為阻斷濾片，裝在物鏡和目鏡之間，只讓燃料所發出的熒光通過。在黑暗背景的襯托下，發出熒光的樣品非常容易被調查。

熒光(guang)顯(xian)微(wei)鏡(jing)技術包括MIAN疫(yi)熒光(guang)(guang)技術和熒光(guang)(guang)素直(zhi)接標志(zhi)技術。例如，將標志(zhi)熒光(guang)(guang)素的(de)(de)(de)純化肌(ji)動卵(luan)白(bai)(bai)顯(xian)(xian)微注射入(ru)培養(yang)細(xi)(xi)胞(bao)中，可以看到肌(ji)動卵(luan)白(bai)(bai)分子組裝成肌(ji)動卵(luan)白(bai)(bai)纖維。可將產生熒光(guang)(guang)的(de)(de)(de)綠色熒光(guang)(guang)卵(luan)白(bai)(bai)基(ji)(ji)因與某(mou)種卵(luan)白(bai)(bai)質基(ji)(ji)因配(pei)備，在(zai)表白(bai)(bai)這種配(pei)備卵(luan)白(bai)(bai)的(de)(de)(de)細(xi)(xi)胞(bao)中，便可直(zhi)接在(zai)活體狀況下調查到該卵(luan)白(bai)(bai)在(zai)活細(xi)(xi)胞(bao)內的(de)(de)(de)動態(tai)變化。不(bu)同(tong)熒光(guang)(guang)素的(de)(de)(de)激(ji)發波長局(ju)限不(bu)同(tong)，所以同(tong)一(yi)樣品可以用(yong)兩種以上的(de)(de)(de)熒光(guang)(guang)素標志(zhi)，同(tong)時(shi)顯(xian)(xian)示不(bu)同(tong)成分在(zai)細(xi)(xi)胞(bao)中的(de)(de)(de)定(ding)位(wei)。