熒光顯微鏡(jing)很關鍵的問題是濾光片的組合，激發濾光片與屏蔽濾片都要適合于被觀察的熒光體并相互匹配。對一些特定用途，選擇濾光片若有錯誤，有可能產生誤解，甚至錯誤的結果。熒光顯微技術的成就和高質量濾光片及巧妙配用濾光片組是不可分隔的，熒光顯微鏡的濾光片種類有以下幾種。

①吸(xi)熱濾光片

吸(xi)熱濾(lv)光(guang)片是防止光(guang)源(yuan)光(guang)譜中(zhong)的(de)熱輻射線損傷光(guang)具組(zu)所(suo)必(bi)需的(de)濾(lv)光(guang)片。較早(zao)的(de)高配置顯微鏡(jing)配備有可裝蒸餾水的(de)鼓形瓶充(chong)當吸(xi)熱裝置，現代(dai)各類大型研(yan)究(jiu)用的(de)顯微鏡(jing)在光(guang)源(yuan)燈(deng)箱或叫(jiao)燈(deng)室中(zhong)都裝有玻璃吸(xi)熱濾(lv)光(guang)片，這是一種透明(ming)的(de)微帶黃色(se)的(de)玻璃片，Leitz公司(si)的KG1(2mm)、BG38(4mm)濾光(guang)(guang)片能夠通透近乎所(suo)有(you)紫(zi)外光(guang)(guang)和可(ke)視光(guang)(guang)光(guang)(guang)譜，是通光(guang)(guang)量可(ke)達98%的濾光片。它只選擇性(xing)吸收紅外光熱(re)輻(fu)射(she)線。

②激發(fa)濾光片

激(ji)發濾光片(pian)(pian)(pian)可以選擇性吸收(shou)長波(bo)譜線而只通透紫外(wai)線，紫色(se)、藍(lan)色(se)和綠(lv)色(se)光線的濾光片(pian)(pian)(pian)為(wei)激(ji)發濾光片(pian)(pian)(pian)。Zeiss公司(si)(si)、Reichert公司(si)(si)、Olympus公司(si)(si)的B系(xi)列(lie)(lie)(lie)、G系(xi)列(lie)(lie)(lie)、BG系(xi)列(lie)(lie)(lie)，Shott公司(si)(si)的UG系(xi)列(lie)(lie)(lie)，Opton公司(si)(si)的H、G、BP系(xi)列(lie)(lie)(lie)，Leitz公司(si)(si)的BP系(xi)列(lie)(lie)(lie)等濾光片(pian)(pian)(pian)均屬激(ji)發濾光片(pian)(pian)(pian)。

③阻擋濾光片

阻擋(dang)濾光片是選擇性吸(xi)收短波譜(pu)線和紅(hong)外(wai)線而通(tong)透較長波可視(shi)線的濾光片，其功能是使觀察者能夠看到被檢物體所激發出來(lai)的熒(ying)光，同時(shi)保護觀察者的角膜免遭紫外(wai)線傷害(hai)。

④色光分離濾光片(pian)

色光分離濾光片是將激發光反射到被檢物體上，使被檢物體激發出熒光，再將熒光透射到目鏡的濾光反射鏡。這類濾光片只能用于落射光聚光器中，而透射光熒光顯微鏡不需要色光分離。

⑤干涉(she)濾(lv)光片

干涉(she)濾(lv)(lv)光(guang)(guang)片(pian)(pian)是(shi)(shi)高性能激發(fa)濾(lv)(lv)光(guang)(guang)片(pian)(pian)的(de)一(yi)種(zhong)。它(ta)是(shi)(shi)將數(shu)張薄(bo)層金(jin)屬膜(mo)(mo)疊放在(zai)拋光(guang)(guang)的(de)兩張玻璃片(pian)(pian)之(zhi)間制成(cheng)的(de)濾(lv)(lv)光(guang)(guang)片(pian)(pian)。每張薄(bo)金(jin)屬膜(mo)(mo)的(de)折(zhe)光(guang)(guang)系數(shu)都不相同，因此(ci)照明光(guang)(guang)源的(de)各種(zhong)不同波長(chang)的(de)譜(pu)線(xian)(xian)在(zai)每張金(jin)屬薄(bo)膜(mo)(mo)上反復進行反射(she)，使得(de)(de)某些波長(chang)的(de)譜(pu)線(xian)(xian)因相消干涉(she)而抵消，另一(yi)些波長(chang)的(de)譜(pu)線(xian)(xian)相加干涉(she)而得(de)(de)以(yi)加強(qiang)，并透(tou)射(she)過去，這樣得(de)(de)到(dao)透(tou)射(she)波譜(pu)很窄、半波峰寬度(du)只有6~20nm.透(tou)光(guang)(guang)度(du)可(ke)達到(dao)60%~70%的(de)濾(lv)(lv)光(guang)(guang)片(pian)(pian)。