熒(ying)光(guang)顯微鏡采(cai)(cai)用(yong)透射激發(fa)時，可以使用(yong)蘭色光線根據普通(tong)明(ming)場(chang)照明(ming)法進行照明(ming)系統(tong)的調(diao)節(jie)(jie)(jie)，這(zhe)包括(kuo)光源調(diao)節(jie)(jie)(jie)及(ji)聚(ju)光鏡中(zhong)心的調(diao)節(jie)(jie)(jie)。如果采(cai)(cai)用(yong)暗(an)場(chang)聚(ju)光鏡，則還需要(yao)(yao)注意(yi)暗(an)場(chang)聚(ju)光鏡的使用(yong)及(ji)調(diao)節(jie)(jie)(jie)方法，當用(yong)蘭色光線調(diao)節(jie)(jie)(jie)好(hao)后，就可采(cai)(cai)用(yong)更換濾色片的方法，使標本(ben)得到所(suo)需要(yao)(yao)的激發(fa)光線照射標本(ben)，但要(yao)(yao)注意(yi)使遏(e)止濾光片已在光路中(zhong)，這(zhe)樣可以保(bao)護觀察者眼睛免受紫外線損傷。

熒(ying)光顯微鏡采用(yong)反(fan)射激發時，先在光(guang)(guang)(guang)路中(zhong)(zhong)加入綠色激發濾光(guang)(guang)(guang)片組(zu)，把照(zhao)明可(ke)(ke)變孔(kong)徑光(guang)(guang)(guang)闌與視場光(guang)(guang)(guang)闌完全打開，調(diao)節光(guang)(guang)(guang)源(yuan)(yuan)(yuan)位置，使(shi)照(zhao)明光(guang)(guang)(guang)束(shu)通過物(wu)(wu)鏡(jing)轉(zhuan)換器(qi)的(de)螺孔(kong)中(zhong)(zhong)央(yang)并(bing)使(shi)光(guang)(guang)(guang)源(yuan)(yuan)(yuan)成象(xiang)于(yu)物(wu)(wu)平面(mian)上，此(ci)時物(wu)(wu)鏡(jing)螺孔(kong)應(ying)是通孔(kong)（不(bu)裝物(wu)(wu)鏡(jing)）。檢(jian)查激發光(guang)(guang)(guang)束(shu)是否(fou)通過物(wu)(wu)鏡(jing)螺孔(kong)中(zhong)(zhong)央(yang)，可(ke)(ke)在螺孔(kong)端(duan)面(mian)上放(fang)置半透明紙(zhi)觀察(cha)光(guang)(guang)(guang)源(yuan)(yuan)(yuan)光(guang)(guang)(guang)斑是否(fou)居中(zhong)(zhong)，在某(mou)些顯微(wei)鏡(jing)中(zhong)(zhong)，光(guang)(guang)(guang)源(yuan)(yuan)(yuan)是在垂(chui)直面(mian)內調(diao)節其上下(xia)左右位置，而光(guang)(guang)(guang)源(yuan)(yuan)(yuan)成象(xiang)是通過集光(guang)(guang)(guang)鏡(jing)沿軸方向移動來達到的(de)。

熒光(guang)顯微(wei)鏡在安(an)裝(zhuang)光(guang)源(yuan)時(shi)要注意光(guang)源(yuan)表面不(bu)能(neng)沾污手指印(yin)及其他斑痕，以(yi)免點(dian)燃過后，難(nan)以(yi)清潔，因此(ci)，新安(an)裝(zhuang)光(guang)源(yuan)時(shi)，使(shi)用前燈(deng)殼表面可用紗(sha)布蘸(zhan)上(shang)酒精等有機溶(rong)劑揩檫干凈，此(ci)外(wai)，還需要注意電極方(fang)(fang)向(xiang)，根(gen)據(ju)光(guang)源(yuan)要求(qiu)進行安(an)裝(zhuang)，以(yi)免發(fa)生意外(wai)或點(dian)燃不(bu)亮(liang)，燈(deng)管應(ying)裝(zhuang)入燈(deng)箱內方(fang)(fang)可點(dian)燃，以(yi)防萬一爆(bao)炸傷人(ren)。激發(fa)濾光(guang)片(pian)及遏止濾光(guang)片(pian)如(ru)何(he)組(zu)合使(shi)用應(ying)根(gen)據(ju)不(bu)同熒光(guang)標本(ben)的激發(fa)方(fang)(fang)法進行選(xuan)(xuan)擇，一般(ban)也可根(gen)據(ju)使(shi)用說明書推薦的配套方(fang)(fang)法進行選(xuan)(xuan)用。