熒光顯微鏡是以紫外線為光源用以照射被檢物體使之發出熒光，然后在顯微鏡下觀察物體的形狀及其所在位置。熒光顯微鏡用于研究細胞內物質的吸收、運輸、化學物質的分布及定位等。細胞中有些物質，如葉綠素等，受紫外線照射后可發熒光;另有些物質本身雖不能發熒光，但如果用熒光染料或熒光抗體染色后，經紫外線照射亦可發熒光，熒光顯微鏡就是對這類物質行定性和定量研究的工具之一。

來看看熒光顯微鏡的折疊濾色系統，濾色系統是熒光顯微鏡的重要部位，由激發濾板和壓制濾板組成。濾板型號，各廠家名稱常不統一。激發濾板根據光源和熒光色素的點，可選用以下三類激發濾板，提供定波長范圍的激發光。

紫外光激發濾板:此濾板可使400nm以下的紫外光透過，阻擋400nm以上的可見光通過。

紫外藍光激發濾板:此濾板可使300~450nm范圍內的光通過。

紫藍光激發濾板:它可使350~490nm的光通過。

大吸收峰在500nm以上者的熒光素可用藍綠濾板激發。